دوره آموزش Single Cell؛ از مفاهیم پایه تا تحلیل داده‌های تک‌سلولی

فناوری‌های Single Cell با فراهم‌کردن امکان بررسی ویژگی‌های مولکولی سلول‌ها به‌صورت منفرد، تحول مهمی در زیست‌شناسی سلولی و مولکولی، ژنتیک، سرطان‌شناسی و پزشکی ایجاد کرده‌اند. برخلاف روش‌های Bulk که میانگین اطلاعات تعداد زیادی سلول را ارائه می‌دهند، تکنیک‌های تک‌سلولی می‌توانند ناهمگونی سلولی، جمعیت‌های نادر، حالت‌های مختلف سلولی و تغییرات بیان ژن را با وضوح بسیار بالاتری آشکار کنند. Single-cell RNA sequencing (scRNA-seq) یکی از مهم‌ترین فناوری‌های این حوزه است که امکان بررسی پروفایل بیان ژن در هزاران سلول را به‌صورت هم‌زمان فراهم می‌کند.

در دوره آموزش Single Cell، شرکت‌کنندگان با اصول و کاربردهای فناوری‌های تک‌سلولی، طراحی آزمایش، آماده‌سازی نمونه، روش‌های مختلف Single-cell sequencing و مفاهیم پایه تحلیل داده‌های Single Cell آشنا می‌شوند. مباحث دوره از شناخت فناوری و انتخاب روش مناسب تا بررسی داده‌ها و تفسیر نتایج پیش می‌رود و تلاش می‌شود ارتباط میان مفاهیم آزمایشگاهی و تحلیل‌های محاسباتی به‌صورت کاربردی آموزش داده شود.

یکی از بخش‌های مهم این حوزه، تحلیل داده‌های Single-cell RNA sequencing است؛ جایی که می‌توان جمعیت‌های سلولی مختلف را شناسایی و دسته‌بندی کرد، ژن‌های نشانگر را بررسی کرد، تغییرات حالت سلولی را مورد مطالعه قرار داد و مسیرهای احتمالی تمایز و تغییرات سلولی را تحلیل کرد. کاربرد این فناوری در تحقیقات سرطان نیز بسیار گسترده است و می‌تواند به بررسی ناهمگونی تومور، ریزمحیط تومور، پاسخ به درمان و شناسایی اهداف درمانی جدید کمک کند.

همچنین در این دوره با چشم‌انداز فناوری‌های پیشرفته‌تر مانند Single-cell Multi-omics، Single-cell DNA sequencing و ارتباط Single-cell با Spatial Omics آشنا خواهید شد؛ حوزه‌هایی که امکان مطالعه هم‌زمان یا یکپارچه اطلاعات ژنومی، ترانسکریپتومی، اپی‌ژنتیکی و پروتئومی را در سطح سلول فراهم می‌کنند.

سرفصل‌های دوره آموزش Single Cell

آشنایی با مفاهیم و مبانی فناوری‌های Single Cell
تفاوت روش‌های Bulk و Single-cell sequencing
معرفی Single-cell RNA sequencing (scRNA-seq)
اصول طراحی آزمایش و آماده‌سازی نمونه‌های تک‌سلولی
روش‌های جداسازی و بارکدگذاری سلول‌ها
آشنایی با پلتفرم‌ها و تکنیک‌های رایج Single Cell
اصول اولیه تولید و مدیریت داده‌های Single-cell
آشنایی با مراحل Preprocessing و Quality Control
شناسایی و دسته‌بندی جمعیت‌های سلولی
بررسی Cell Clustering و Cell Type Annotation
تحلیل بیان ژن و شناسایی ژن‌های نشانگر
آشنایی با Differential Gene Expression Analysis
بررسی مسیرهای سلولی و Functional Analysis
آشنایی با Trajectory Analysis و Cell State
اصول ادغام و مقایسه داده‌های Single-cell
آشنایی با Single-cell Multi-omics
کاربردهای Single Cell در سرطان، ایمونولوژی، بیماری‌ها و تحقیقات سلولی
آشنایی با Spatial Transcriptomics و ارتباط آن با Single Cell
بررسی چالش‌ها، محدودیت‌ها و خطاهای رایج در مطالعات Single-cell
معرفی ابزارها و منابع کاربردی برای تحلیل و تفسیر داده‌های تک‌سلولی

دوره آموزش Single Cell برای دانشجویان و فارغ‌التحصیلان رشته‌های زیست‌شناسی سلولی و مولکولی، ژنتیک، بیوتکنولوژی، علوم آزمایشگاهی، پزشکی و رشته‌های مرتبط و همچنین پژوهشگرانی که قصد دارند دانش خود را در زمینه فناوری‌های نوین Single Cell توسعه دهند، طراحی شده است.